قال الدكتور محمد بديع المرشد العام لجماعة الإخوان المسلمين من داخل القفص خلال محاكمته المنعقدة في معهد أمناء الشرطة بطرة أن "النيابة ليست طرفا محايدا فى القضية لأن النائب العام عينته سلطات الانقلاب العسكري، على حد وصفه، وما حدث لم يحدث فى تاريخ مصر".
وأضاف بديع قائلا: "روحوا حققوا فى مذبحة رابعة جريمة العصر واصفا ما تقوم به النيابة بالسحر وأنه قلب للحقائق وذكر قول الله تعالى "ما جئتم به السحر أن الله سيبطله إن الله لايصلح عمل المفسدين".
بينما قال الدكتور محمد البلتاجي، القيادي بجماعة الإخوان المسلمين ، بحسب ما أوردته "بوابة الأهرام" إن النيابة العامة تقول إن ما حدث فى مصر يوم 25 يناير 2011 لم يكن ثورة ولكنه احتلالا عسكريا لسيناء من حماس وحزب الله بأكملها، وتساءل إذا كان ما حدث احتلالا عسكريا فأين كان الجيش فى ذلك الوقت؟ و لماذا لم يعلن حالة التعبئة العامة ويقاوم هذا الاحتلال؟".
